Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms