Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms