Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD2Q9BSE4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms