Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms