Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3AQ96ST3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms