Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms