Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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C2orf48Q96LS8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C2orf48Q96LS8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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