Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX27Q96L92 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms