Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms