Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNDC1Q96C34 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms