Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-208ENST00000510326 567 ntTSL 26□□□□□ -1.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EIF2AK4-203ENST00000558629 4374 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-206ENST00000480976 553 ntTSL 45.95□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FGD4-214ENST00000550091 549 ntTSL 45.93□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-209ENST00000430527 569 ntTSL 55.92□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-225ENST00000529489 554 ntTSL 55.87□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDAH1-203ENST00000483110 3905 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-203ENST00000526391 757 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.487e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STIP1-205ENST00000537479 601 ntTSL 25.74□□□□□ -1.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STIP1-206ENST00000538497 582 ntTSL 25.74□□□□□ -1.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.57e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF343-206ENST00000465019 3172 ntTSL 25.7□□□□□ -1.57e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PIGF-204ENST00000420164 586 ntTSL 55.63□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CHKA-208ENST00000533910 864 ntTSL 35.61□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-203ENST00000462644 904 ntTSL 35.59□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.527e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 25.52□□□□□ -1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.544e-8■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-214ENST00000492116 582 ntTSL 25.45□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SENP5-203ENST00000434433 622 ntTSL 35.41□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.547e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CTTNBP2NL-202ENST00000441739 1014 ntTSL 35.31□□□□□ -1.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF808-206ENST00000487863 4233 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.567e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EFL1-208ENST00000561331 557 ntTSL 45.21□□□□□ -1.587e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.587e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CHKA-204ENST00000528235 570 ntTSL 55.19□□□□□ -1.587e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.67e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-202ENST00000418819 849 ntTSL 34.95□□□□□ -1.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 POLR3E-206ENST00000563282 448 ntTSL 24.93□□□□□ -1.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP58-209ENST00000476553 564 ntTSL 44.92□□□□□ -1.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-207ENST00000488893 736 ntTSL 54.92□□□□□ -1.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.82□□□□□ -1.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AKAP7-207ENST00000535150 1041 ntTSL 34.75□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-203ENST00000466029 223 ntTSL 34.74□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTHFD1-206ENST00000554353 556 ntTSL 24.72□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-211ENST00000467755 370 ntTSL 1 (best)4.62□□□□□ -1.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-218ENST00000467162 803 ntTSL 34.52□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1-214ENST00000489603 531 ntTSL 34.52□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 54.5□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 34.5□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-208ENST00000609525 581 ntTSL 54.49□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-202ENST00000538134 566 ntTSL 34.48□□□□□ -1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-205ENST00000518684 605 ntTSL 34.33□□□□□ -1.727e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 24.21□□□□□ -1.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 54.2□□□□□ -1.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 54.18□□□□□ -1.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-210ENST00000547141 315 ntTSL 24.05□□□□□ -1.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 54.03□□□□□ -1.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 33.97□□□□□ -1.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATM-204ENST00000524792 5912 ntTSL 23.94□□□□□ -1.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATM-223ENST00000533979 705 ntTSL 33.8□□□□□ -1.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1-206ENST00000464608 564 ntTSL 33.71□□□□□ -1.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MCTP2-202ENST00000449432 836 ntTSL 23.64□□□□□ -1.837e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STIP1-212ENST00000544739 562 ntTSL 33.45□□□□□ -1.867e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KIF5B-202ENST00000493889 494 ntTSL 23.34□□□□□ -1.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SRBD1-205ENST00000493649 655 ntTSL 43.33□□□□□ -1.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 23.3□□□□□ -1.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.897e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-209ENST00000546469 485 ntTSL 33.12□□□□□ -1.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRPL1-202ENST00000502384 898 ntTSL 53.11□□□□□ -1.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.927e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRB14-204ENST00000469573 984 ntTSL 23.03□□□□□ -1.927e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NBAS-204ENST00000427792 442 ntTSL 23.01□□□□□ -1.937e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-212ENST00000474653 573 ntTSL 22.95□□□□□ -1.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-213ENST00000550131 349 ntTSL 22.84□□□□□ -1.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRAMD4-207ENST00000490378 193 ntTSL 32.83□□□□□ -1.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FOXN3-217ENST00000557572 513 ntTSL 32.82□□□□□ -1.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRB14-202ENST00000424693 587 ntTSL 42.76□□□□□ -1.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAOK1-206ENST00000587277 353 ntTSL 22.73□□□□□ -1.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.987e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-204ENST00000439052 1305 ntTSL 22.66□□□□□ -1.987e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.31□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PTPN12-204ENST00000418110 564 ntTSL 42.28□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-205ENST00000455338 352 ntTSL 52.19□□□□□ -2.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-206ENST00000476518 602 ntTSL 32.08□□□□□ -2.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 52.05□□□□□ -2.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 52.05□□□□□ -2.087e-6■■■■■ 27.5
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