Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM54Q969K7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms