Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRAT1Q92837 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms