Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM9SF4Q92544 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms