Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3BQ92485 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMPDL3BQ92485 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms