Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms