Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF4Q8WXU2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms