Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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