Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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C9orf40Q8IXQ3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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