Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms