Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMPRSS12Q86WS5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms