Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms