Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX20Q7Z614 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms