Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CATSPER4Q7RTX7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CATSPER4Q7RTX7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms