Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TCF23Q7RTU1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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