Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MICAL3Q7RTP6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MICAL3Q7RTP6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms