Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
METAP1DQ6UB28 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms