Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO38Q6PIJ6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms