Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSAG1Q6PB30 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms