Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMBOX1Q6NT76 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms