Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RIF1Q5UIP0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIF1Q5UIP0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms