Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HES3Q5TGS1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HES3Q5TGS1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms