Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms