Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms