Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR44Q5JSH3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms