Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD12Q587J7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms