Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms