Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms