Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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