Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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