Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms