Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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