Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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