Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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