Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
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