Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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