Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms