Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms