Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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