Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF4Q15306 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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